Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS4Q9NRS4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms