Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYLDQ9NQC7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYLDQ9NQC7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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