Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VAMP8Q9BV40 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms