Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms