Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms