Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BORCS6Q96GS4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms