Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms