Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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C10orf53Q8N6V4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf53Q8N6V4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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