Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMCO5AQ8N6Q1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms