Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms