Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP20A1Q6UW02 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms