Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms