Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STRIP1Q5VSL9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms