Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms