Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCSK7Q16549 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms