Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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PMCHL1Q16048 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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PMCHL1Q16048 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL1Q16048 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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