Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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