Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TAF1AQ15573 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF1AQ15573 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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