Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRD3Q15059 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms