Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB39AQ14964 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms