Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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