Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SSPNQ14714 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms