Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms