Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CKAP5Q14008 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms