Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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MKRN4PQ13434 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MKRN4PQ13434 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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