Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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