Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACACAQ13085 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms