Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TRAF1Q13077 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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