Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYCNQ0VAF6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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