Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK18Q07002 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK18Q07002 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms