Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAV1Q03135 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms