Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC2Q02487 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms