Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms