Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms