Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms