Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms