Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3M2P53677 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms