Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERFP50548 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERFP50548 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ERFP50548 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERFP50548 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms