Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD4P46934 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD4P46934 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms