Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACADSBP45954 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms