Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMB4P28070 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms