Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNA2P20248 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNA2P20248 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNA2P20248 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNA2P20248 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms