Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NELFEP18615 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NELFEP18615 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NELFEP18615 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NELFEP18615 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NELFEP18615 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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NELFEP18615 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NELFEP18615 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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