Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD2P13995 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms