Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2P0DI81 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2P0DI81 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms