Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZBED1O96006 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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