Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PRAMEF10O60809 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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