Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLRF2D3W0D1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms