Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HACD1B0YJ81 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms