Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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